Источник страха — деятельность бессознательного . Согласно теории, которой придерживаются современные учёные, боязнь начинается не сразу, а формируется постепенно. Человек, понимая, что в некоторых ситуациях испытывает боль, стыд, неловкость или другую негативную эмоцию начинает их избегать. Тем временем подавленные эмоции усиливаются.
У этой теории есть и противники со своими доводами. Они утверждают, что большинство людей с боязнью супружества ни разу не сталкивались с тем, чего опасаются. Тревожность сформировалась у них под влиянием фильмов, передач, рассказов знакомых. Чужой опыт мозг может воспринимать как пережитый, поэтому развивается расстройство.